Prevence a kontrola infekcí je řešena Oddělením kontroly infekcí a nemocniční hygieny ve úzké spolupráci s Oddělením klinické mikrobiologie.
Vedoucí pracovníci obou oddělení jsou také členy Komise pro prevenci a kontroly infekcí v přímé podřízenosti ředitele FN Brno, vzniklé podpisem statutu 28. ledna 2013.